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股份轉換時之利益衝突與迴避問題
若A公司為B公司之股東或擔任B公司之董事，則當A公司與B公司擬進行股份轉換時，A公司於B公司關於股份轉換事項之股東會或董事會決議時，是否得行使表決權？
依企業併購法之規定，於公司合併時，公司持有其他參加合併公司之股份，或該公司或其指派代表人當選為其他參加合併公司之董事者，就其他參與合併公司之合併事項為決議時，得行使表決權。至於股份轉換，依據經濟部91年6月3日函釋，則認為並無此規定之適用。雖然企業併購法之修正草案中，已研擬新增準用之規定，但尚屬研議中。
經濟部為解決此實務上爭議，於95年12月21日召開會議，認為股份轉換決議過程中，關於董事及股東利益衝突及迴避問題，應回歸公司法關於迴避之規定處理。於具體個案應具備有「自身利害關係」及「致有害於公司利益之虞」二項要件，始有此等迴避規定之適用。
另依企業併購法規定，公司為併購決議時，董事會應為全體股東之最大利益行之，並應以善良管理人之注意，處理併購事宜；且就併購事項，應委請獨立專家就換股比例等提供合理意見。經濟部會議決議認為，具體個案如符合此等規定，而不發生有害公司利益之虞情事，則得參與表決。