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未換發股份予異議股東之處理
A公司與B公司決議合併，以B公司為消滅公司，B公司有反對合併之異議股東，於合併基準日時，該異議股東所持有之B公司股份將因合併而銷除，但是否得換發A公司股份，於實務上迭生爭議。
依據最高法院69年判決見解，法院裁定公司收買股份之價格，非自裁定起即生股份移轉之效力。故股份之移轉效力，應自價款交付時生效。故對於異議股東所持有之股份，若於合併基準日尚未完成價款之交付，公司於合併時即應換發股份予該異議股東。
惟實務上若異議股東之股份已因合併而銷除，且經向主管機關完成登記，是否應重新申請變更登記或公司應支付異議股東價款？經濟部為釐清此爭議，於95年12月21日召開會議，認為如重新申請合併之變更登記，則原核准之合併案處分應予撤銷回復原狀，但原因合併而消滅之公司實際上已不復存在，實務上並無法回復原狀或再重新辦理登記。故經濟部決議參酌台北地方法院86年判決，認為應以公司支付異議股東價款之方式處理為宜。