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專利程序審查基準修正
智慧財產局日前修正專利程序審查基準，並於2006年10月公告修正基準，其修正要點如下：
簡化簽章之程序審查
申請讓與登記、申請信託登記、申請提早公開、撤回、拋棄及申請審查中、未核准、異議、舉發等案之閱卷，由於其屬重要事項，且影響權利人之權益甚巨，因此，權利人之簽章，必須與卷存一致，如有不一致，智慧財產局局將通知申請人補正，補正方式則有使其一致，或申請變更簽章，或以切結方式代替。其他類型申請事項，只要申請人於申請書上有簽章即可，將不再審核是否與卷存一致。
簡化舉發書證之程序審查
針對舉發書證，程序審查階段將不要求申請人必須檢附正本或原本，或影本必須證明、釋明。舉發書證如為外文本，除非被舉發人要求中文譯本或節譯本，程序審查階段亦將不要求舉發人補正中文譯本或節譯本。
明定影響申請日取得之情形
申請發明或新型專利以申請書、說明書及必要圖式齊備之日為申請日；申請新式樣專利，則以申請書及圖說齊備之日為申請日。發明專利必須具備申請書、發明專利說明書及必要圖式；申請新型專利必須具備申請書、新型專利說明書及圖式；申請新式樣專利必須具備申請書及圖說。說明書內容至少必須載明發明說明（新型說明）及申請專利範圍，圖說至少必須載明圖面。
釐清缺頁缺漏之法律效力
依專利法施行細則第21條規定，說明書有部分缺頁或圖式或圖面有部分缺漏之情事者，以補正之日為申請日。前述情形係指發明專利說明書、新型專利說明書缺頁，導致完全無載明發明說明或申請專利範圍。發明或新型專利圖式缺漏（致完全無必要圖式）、新型專利完全無圖式、新式樣專利圖面缺漏（致圖說完全無圖面），而申請人於事後補正者，則以補正之日為申請日而言。
明定影響以外文本取得申請日之情形
發明專利以外文本先行提出者，如該外文說明書未載明發明說明及申請專利範圍，外文圖說未載明圖面，將影響申請日之取得。外文本並無專利法施行細則第21條所訂缺頁或缺漏規定之適用。外文本如有部分缺頁或缺漏，但並非完全無上開情事時，僅需補正完整外文本，並以外文本提出之日為申請日。
明定專利代理人死亡，委任關係消滅，後續處理程序
專利代理人死亡時，其與申請人間委任關係已消滅，申請人必須主動函知本局，另行委任代理人或自行辦理，始為適法。申請人如未通知本局，而該事實於本局已知悉者，將為以下處理方式：
1.申請人為本國人時：逕向申請人為送達，並說明本案代理人已歿，依法委任關係消滅，請另行委任代理人或改為自行辦理。另為兼顧申請人之權益，使事務所能即時提供申請人專業意見，另以副本送達代理人之事務所。訴願或行政訴訟之案件於答辯時，答辯函以副本送達申請人及代理人之事務所。
2.申請人為外國人時：由於本局原則上不對國外送達，因此，本局將通知代理人事務所，請轉知申請人，3個月內辦理另行委任代理人事宜。倘屆期未復，再逕行送達國外申請人，請其依法委任代理人。
放寬聲明事項之程序審查
聲明主張新穎性優惠期、國際優先權、國內優先權及聲明生物材料專利申請案已寄存之事實，只要申請專利時，客觀上足以判斷申請人已具有聲明主張之意思，則視為有聲明主張，如申請人意思未明，本局將函請申請人補充敘明，至於聲明事實及應載明事項未齊備者，屬得補正事項。惟，聲明主張，必須申請時即聲明，不得事後聲明主張。
放寬圖式繪製方式之程序審查
如圖式不清晰或新型申請案之圖式係照片並非以繪製而成，程序審查將通知補正，屆期未補正，將處分該申請案不受理。申請發明專利，圖式是否必要，依申請人主觀意思自行決定。惟，是否因此而影響專利要件，將於實體審查中審理之。
明定非法人團體得為舉發人
非法人團體，設有代表人或管理人者，亦得作為舉發人。至獨資之商號係由一個自然人出資之商號，其財產仍歸屬出資之自然人個人，不具獨立人格，亦非非法人之團體，其舉發仍以該自然人為當事人。
增訂第12章專利權管理
針對專利權之取得、專利權之維持、專利權之異動及消滅等相關事宜，增訂相關基準。