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智慧財產行政訴訟事件電子訴訟(線上起訴)系統已於2015年7月20日啟用
依據世界銀行於2014年10月所發布「2015經商環境報告」(Doing Business 2015)，於189個經濟體中，全球19個經濟體准許使用電子起訴。為促進我國之經濟競爭力及推動環保無紙化，司法院於2014年即已積極規劃電子訴訟(線上起訴)系統，並於2014年底即已開放測試使用一個月餘。於收到相關測試回饋後，再於2015年6月開始再次接受大規模測試使用，蒐集各大事務所試用意見及據此陸續修改調整系統之作業。經7月上旬緊鑼密鼓之測試、調整及確認後，司法院已於2015年7月20日盛大舉行啟動儀式，本所並於本系統啟用後於當日上午約11時隨即應用該系統提出智慧財產案件之行政起訴狀。
由於此為我國首次啟用此種電子訴訟(線上起訴)系統，故2015年7月20日開始啟用之案件類型限於「智慧財產行政訴訟事件」，並預計於2015年9月間開始適用至「稅務行政事件」，且於2016年初適用於普通法院之一審及二審民事訴訟，日後亦將逐步擴展適用範圍。
智慧財產行政訴訟事件電子訴訟(線上起訴)系統可用於提起訴訟，因目前智慧財產行政訴訟之被告多為經濟部智慧財產局（下稱「智慧局」），該局亦已表示將配合系統之使用，如原告於本系統提起行政訴訟，即屬已將繕本送達於智慧局。完成線上遞狀後，原告不須再呈遞書狀正本及繕本予智慧財產法院，智慧局亦將透過本系統以電子方式上傳答辯狀。案件中如有參加人且該參加人有委任律師代理者，承辦法官將鼓勵該律師亦配合使用此系統，並藉由本系統呈遞參加答辯相關書狀。此外，司法院並強調本系統限於當事人間交換書狀及證物之用，法院發函時仍將以紙本送達當事人。另，智慧財產法院並將發布「智慧財產法院關於智慧財產行政訴訟事件電子訴訟系統之作業辦法」以作為法規依據。
由於此系統僅開放由律師及專利師使用，故如當事人並未委任律師或專利師代理者，則無法使用此系統。惟查，由於行政訴訟案件委任律師及專利師之比例較高，故仍可預期於系統經普遍使用後，將大幅度提高相關訴訟文書作業之效率，並減少紙類文書之製作，達成促進環保及經濟之雙重目的。